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Text File  |  1995-03-04  |  1.1 KB  |  23 lines

  1. *************************************
  2. * Glycosaminoglycan attachment site *
  3. *************************************
  4.  
  5. Proteoglycans [1]  are  complex  glycoconjugates  containing a core protein to
  6. which a variable number of glycosaminoglycan chains  (such as heparin sulfate,
  7. chondroitin sulfate, etc.) are covalently attached. The glycosaminoglycans are
  8. attached to  the  core  proteins through  a xyloside residue which is  in turn
  9. linked to  a serine   residue of the protein.    A consensus sequence for  the
  10. attachment  site seems  to exist [2].   However,  it must be noted  that  this
  11. consensus is only based on the sequence of three proteoglycan core proteins.
  12.  
  13. -Consensus pattern: S-G-x-G
  14.                     [S is the attachment site]
  15.  Additional rule: There must be at least  two acidic amino acids from -2 to -4
  16.                   relative to the serine.
  17. -Last update: June 1988 / First entry.
  18.  
  19. [ 1] Hassel J.R., Kimura J.H., Hascall V.C.
  20.      Annu. Rev. Biochem. 55:539-567(1986).
  21. [ 2] Bourdon M.A., Krusius T., Campbell S., Schwarz N.B.
  22.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84:3194-3198(1987).
  23.